Эпидемиология и молекулярная характеристика вирусов птичьего гриппа А подтипов H5N1 и H3N8 на птицефабриках и рынках живой птицы в Бангладеш

Научные отчеты, том 13, Номер статьи: 7912 (2023) Цитировать эту статью

830 Доступов

11 Альтметрика

Подробности о метриках

Вирус птичьего гриппа (ВГП) остается глобальной угрозой, при этом водоплавающие птицы служат основным резервуаром, из которого вирусы распространяются к другим хозяевам. Вирусы высокопатогенного птичьего гриппа (ВПГП) H5 продолжают представлять собой разрушительную угрозу для птицеводческой отрасли и начинающуюся угрозу для людей. В семи районах Бангладеш было проведено поперечное исследование с целью оценки распространенности и подтипов (H3, H5 и H9) вируса гепатита птичьего гриппа у домашней птицы, а также выявления основных факторов риска и филогенетического анализа вирусов вируса гриппа подтипов H5N1 и H3N8. Образцы мазков из клоаки и ротоглотки были собраны у 500 птиц на рынках живой птицы (LBM) и птицефабриках. У каждой птицы были взяты пробы из клоаки и ротоглотки, а затем собраны для дальнейшего анализа. Объединенные образцы были проанализированы на наличие гена матрицы (М) вируса гриппа А (IAV) с последующим молекулярным субтипированием H5 и H9 с использованием полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в реальном времени (рОТ-ПЦР). Положительные образцы вируса гриппа А, не относящиеся к H5 и H9, были секвенированы для выявления возможных подтипов. Отобранные H5-положительные образцы подвергали секвенированию генов гемагглютинина (HA) и нейраминидазы (NA). Для анализа факторов риска использовалась многомерная логистическая регрессия. Мы обнаружили, что распространенность гена IAV M составила 40,20% (95% ДИ 35,98–44,57), при этом 52,38%, 46,96% и 31,11% были обнаружены у кур, водоплавающих птиц и индеек соответственно. Распространенность H5, H3 и H9 достигла 22%, 3,4% и 6,9% соответственно. Водоплавающие птицы имели более высокий риск заражения AIV (AOR: 4,75) и H5 (AOR: 5,71) по сравнению с курами; в зимний сезон выявлено больше вируса, чем в летний (AOR: 4,93); мертвые птицы имели более высокий риск обнаружения AIV и H5, чем здоровые птицы, а вероятность обнаружения H5 увеличивалась у LBM. Все шесть секвенированных вирусов H5N1 представляли собой вирусы клады 2.3.2.1a-R1, циркулирующие с 2015 года среди домашних и диких птиц в Бангладеш. 12 вирусов H3N8 в нашем исследовании сформировали две генетические группы, которые имели большее сходство с вирусами гриппа диких птиц в Монголии и Китае, чем с предыдущими вирусами H3N8 из Бангладеш. Результаты этого исследования могут быть использованы для изменения руководящих принципов по контролю и профилактике ВГП с учетом выявленных факторов риска, влияющих на их распространение.

Influenza A virus is a negative-strand RNA virus belonging to Orthomyxoviridae family, and the virion carries surface proteins known as hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA)1. Based on their potential to cause disease in chickens, avian influenza viruses (AIVs) are grouped into two categories: highly pathogenic avian influenza virus (HPAIV) and low pathogenic avian influenza virus (LPAIV)2,3,4. AIVs infect chickens, turkeys, and other gallinaceous birds and inflict significant economic losses worldwide5,6,7. In terms of humans and poultry, Bangladesh is one of the world's most densely populated countries. The poultry industry in Bangladesh supports economic growth and poverty reduction in rural and urban areas by creating employment opportunities and food products8. LPAIVs and HPAIVs, including the highly pathogenic H5N1 viruses, have been found in waterfowl, pet birds, wild birds, and chickens in Bangladesh9,10,11,12,13. In Bangladesh, over 580 outbreaks of HPAI H5N1 have been reported in poultry and wild birds since 200714,15,16. Because the poultry industry accounts for 20% of the livestock sector in Bangladesh, the culling of an estimated 250 million diseased animals to date in response to these outbreaks causes food insecurity and negatively impacted the economic growth17. In addition, eight human cases of H5N1 have been reported in Bangladesh, with one fatality (2020)." href="/articles/s41598-023-33814-8#ref-CR18" id="ref-link-section-d20661986e656"> 18. Инфицирование человека вирусом H5N1 зарегистрировано во Вьетнаме, Таиланде, Индонезии, Гонконге, Китае и Камбодже, во всех из которых имеется история заражения домашней птицы на ММН, а также на коммерческих фермах и фермах свободного выгула, что означает, что как ММН, так и фермы могут внести свой вклад. распространению AIV среди домашней птицы и от домашней птицы к человеку19,20,21,22. Кроме того, источником беспокойства является совместная циркуляция LPAIV.